『名探偵コナン推理ファイル 日本史の謎』は、青山剛昌による漫画作品。小学館 名探偵コナン 推理ファイルから2004年1月〜2009年4月に刊行、既刊4冊。「名探偵コナン」シリーズ5作のうちの1作。青山剛昌が原作の作品はcomic-labに他に67作あり、『テレビアニメ版 名探偵コナン PARTII』『名探偵コナン犯人の犯沢さん』など。comic-labの3軸判定では、内容の近さで『日本の歴史』『はじめての日本の歴史』が上位。
「古代日本史ミステリーにコナンが挑む!! 本格ミステリーまんがと関連する学習記事により、日本史の知識を学べるシリーズの第1…」出版社の紹介文より抜粋(楽天ブックス)